Сделать вертикальные и горизонтальные ступеньки различными блоками. При крафте ступенек будут создаваться горизонтальные, а потом уже посредством перекрафта превращать их в вертикальные.
На скриншоте ниже красным отмечены вертикальные ступеньки, они должны соединяться с горизонтальными как и сейчас.