На крепости игроки могут бить друг друга до начала осады.

Галочка мирность включена, но также включена и галочка "Арена". (Из-за чего игроки и могут бить друг друга)
До начала осады игроки не должны иметь возможность бить друг друга.

О какой крепости идет речь?

Вчера так было на тиме и так же сегодня на клансе.

Галочка "Арена" стоит только у крепости сервера Clans и она не влияет на pvp между игроками - она только убирает начисление кармы за убийство и выпадение вещей.

Значит не из-за нее.
Проверили на дипе: если клан записался, то игроки из этого клана могут бить других игроков до осады.

Больше подобного не наблюдалось. Было только в первые два раза после обновления: 1 на тиме, 2 на клансе.