среды разработки для платформы Java:
- Eclipse IDE for Java Developers
- NetBeans Platform SDK Java SE (dmh-0 разрабатывается именно в нем)
содержат все необходимые компиляторы. Можно компилировать и руками с помощью консольной утилиты javac, входящий в стандартный пакет Java RE (который необходим для работы minecraft)

в качестве декомпилятора используется jad, входящий в состав проекта mcp, который помимо декомпиляции содержит еще и деобфускатор для восстановления человеко понятных названий.