Экспортируете модели в любой формат моделей, например, в текстовый в виде XML, затем ищете и подключаете в Java библиотеку (или пишете вручную), которая импортирует в Java среду эти 3D модели и рисует в майнкрафте, используя OpenGL. Ясен пень, без знания Java не обойтись, но, чтобы вы знали, в майнкрафте каждая модель сделана вручную на Java. Можно найти где-то мод, который позволяет импортировать модели, это как вариант когда для вас Java — это китайская грамота.

P.S. извините что редачу много, слабо соображаю — у меня температура.