Я знал, что вопрос о мышке будет задан. Ей нету и года, и я её проверял, как мог. Кроме майнкрафта, двойных нажатий нигде не наблюдалось.
Кроме того, обратите внимание на это:

То есть прошла секунда, курсор мыши уже в другом месте или инвентарь вообще уже закрыт, и тут количество взятых/положенных предметов меняется.
Проблемы с мышью не могут вызвать такой эффект.