1) (самый частый) закончилось "время жизни" предмета и он просто исчезает (не знаю как еще сказать)
2) на сколько я понял в dmh мод встроена простейшая защита на кол-во лута вокруг игрока (вероятно мне показалось)т.е. когда его вокруг слишком много, он разом исчезает (вероятно влияние лагов...фиг знает)
3) кто-то маленький и быстрый все упер

4) чаще всего лаг+ 1) т.е. лут может пролежать 20мин. вы вылетите чрез 24ч зайдете, а он будет там
однако может случиться и наоборот, т.е. лут вылетит, пролежит пару минут и тютю...
5) если прикол с ураном до сих пор(что крайне мало вероятно) не пофикшен, то он мб виноват)
на счет животных: на сколько мне известно онлайн версия mc крайне плохо относиться к животным, т.е. толи сервер их не сохраняет, толи он о них просто забывааает, точно не помню, читал на форумах про это

вероятно, в 1.0 это исправили в следствии введения приручения животных, но у нас...адм знает всяко лучше

(вспомните мобов до этого, вышли из игры, чрез 5 мин. зашли...усе пусто)