Burs, для работы с MCP нужны уверенные знания Java. Соответственно вы уже должны знать такие основы, как Bash, Java, Gradle и т.п. Без базовых основ не имеет никакого смысла лезть в код. А вы уже лезете в код без базовых основ.

Изучите для начала:
- Что такое Операционная система и как она работает
- Основы работы с Терминалом(в вашем случае bash)
- Что такое Компилятор и зачем он нужен

А потом уже возвращайтесь к вопросу MCP.