На билде высота мира 256, а облака находятся как и раньше от 127 до 150. Нужно чтобы они были на соответствующей высоте.
На других серверах с высотой 256 не тестировалось.

Так и должно быть, ведь и в реале тоже дома есть выше облаков.

Ну это выглядит не очень красиво, когда облака проплывают через постройку.

Добавить в клиенте настройку высоты отрисовки облаков.

Построил большой дом, сидишь в нём и видишь как облака проходят через него, так же облака мешаются при постройке на высоте.

[color=#999999][/color]
Добавить "срезание" облаков блоками, чтобы внутри зданий не шастали, и нормально будет. Высота в норме, выше облаков тоже побывать хочется. Страждущим отключить их в настройках никто не мешает.
[color=#999999][/color]

Дык это всю механику облаков изменить надо будет)) Хотя её всё же стоит изменить... (+ привязать осадки к облакам)