При складывании предметов в ячейки кланового хранилища с зажатой клавишей shift первый предмет пропадает и в первую ячейку складывается только следующий предмет. После закрытия окна управления хранилищем первый предмет оказывается в инвентаре.

При складывании одного телепорта в крепость в клановое хранилище, в списке показывает 32 телепорта. После получения телепорта в инвентаре оказывается все так же 1 телепорт.

При складывании таблеток в клановое хранилище, они бесследно исчезают. Так мной было потеряно пара десятков таблеток.

Не пропадает, а попадает в слот на другой странице диалога(покупка кланового ключа) - аналогично другим подобным интерфейсам.